174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  100 
 
 		 263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0893  putative periplasmic substrate-binding protein  64.45 
 
 		 251 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4823  periplasmic binding protein  53.7 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3557  putative periplasmic substrate-binding protein  55.04 
 
 		 255 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00679911  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2103  hypothetical protein  60.41 
 
 		 243 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000719716  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1031  putative periplasmic substrate-binding protein  52.85 
 
 		 253 aa  248  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.377319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2246  hypothetical protein  59.59 
 
 		 240 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155088  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2810  hypothetical protein  55.12 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3150  hypothetical protein  54.26 
 
 		 290 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2226  periplasmic binding protein  55.69 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2040  hypothetical protein  53.39 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1761  hypothetical protein  54.66 
 
 		 243 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.396883  hitchhiker  0.00317212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0010  putative periplasmic substrate-binding protein  50.38 
 
 		 280 aa  221  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2532  periplasmic binding protein  40.77 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3896  periplasmic binding protein  35.71 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00316656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0112  periplasmic binding protein  35.19 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.195536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3091  periplasmic binding protein  35.84 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4706  periplasmic binding protein  33.44 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2937  periplasmic binding protein  33.21 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000364974  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2323  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0828  periplasmic binding protein  35.66 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3666  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.035512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.67 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3084  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1134  periplasmic binding protein  31.71 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0216627  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0141  hypothetical protein  29.92 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0469  periplasmic binding protein  30.04 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0283  hypothetical protein  30.26 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0184  periplasmic binding protein  31.71 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0133  hypothetical protein  29.55 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.76466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0131  hypothetical protein  31.56 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.881561  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4249  iron ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.65 
 
 		 272 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0726  periplasmic binding protein  32.79 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  30.96 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0100  hypothetical protein  31.52 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.6 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  25.17 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  31.09 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.72 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  32.81 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  30.05 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  28.57 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  28.57 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  29.57 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  28.57 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  28.57 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  28.57 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  28.57 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.77 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  28.57 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  27.31 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  33.91 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1388  iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.28 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.783574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  34.95 
 
 		 318 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  36.63 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  28.3 
 
 		 517 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  26.33 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  30.27 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  26.84 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  29.79 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  33.68 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  28.64 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  33.97 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.13 
 
 		 483 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  30.82 
 
 		 478 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2214  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  29.17 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  25.52 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  30.89 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  22.99 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  31.52 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  26.98 
 
 		 363 aa  55.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  31.89 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3574  periplasmic binding protein  33.52 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136612 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  24.37 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  24.37 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  24.74 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  35.29 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  33.16 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1056  hypothetical protein  27.37 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  35.39 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.94 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>