200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2040 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2040  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  474  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1031  putative periplasmic substrate-binding protein  62.71 
 
 		 253 aa  294  9e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.377319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3557  putative periplasmic substrate-binding protein  64.96 
 
 		 255 aa  294  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00679911  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0010  putative periplasmic substrate-binding protein  63.07 
 
 		 280 aa  280  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2103  hypothetical protein  61.6 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000719716  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2246  hypothetical protein  60.25 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155088  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3150  hypothetical protein  60.43 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1761  hypothetical protein  60.76 
 
 		 243 aa  248  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.396883  hitchhiker  0.00317212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4823  periplasmic binding protein  54.85 
 
 		 252 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2226  periplasmic binding protein  54.71 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2810  hypothetical protein  55.22 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0893  putative periplasmic substrate-binding protein  58.15 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  53.39 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3896  periplasmic binding protein  38.02 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00316656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3091  periplasmic binding protein  40.74 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0112  periplasmic binding protein  40.82 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.195536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2532  periplasmic binding protein  39.34 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2937  periplasmic binding protein  37.04 
 
 		 270 aa  131  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000364974  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0828  periplasmic binding protein  37.4 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2323  periplasmic binding protein  30.29 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4706  periplasmic binding protein  33.21 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1134  periplasmic binding protein  33.19 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0216627  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.04 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3666  periplasmic binding protein  30.94 
 
 		 271 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.035512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3084  periplasmic binding protein  32.92 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0726  periplasmic binding protein  33.05 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0131  hypothetical protein  31.47 
 
 		 275 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.881561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  30.88 
 
 		 341 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0184  periplasmic binding protein  30.89 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0100  hypothetical protein  31.11 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4249  iron ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.8 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0469  periplasmic binding protein  31.76 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0283  hypothetical protein  28.24 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  31.25 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  31.79 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1133  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  28.27 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  27.94 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  27.94 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0133  hypothetical protein  26.77 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.76466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01625  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.46 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  29.9 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  31.94 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.94 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.94 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.94 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.12 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  28.27 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  31.94 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  30.73 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.94 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1039  periplasmic binding protein  27.38 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0141  hypothetical protein  27.17 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  28.19 
 
 		 276 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.48 
 
 		 310 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  27.84 
 
 		 338 aa  71.6  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  30.81 
 
 		 311 aa  72  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 318 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  32.82 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  30.21 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  32.82 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.18 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  25.11 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.74 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  29.17 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.61 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  30.22 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.08 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1388  iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  23.3 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.783574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  28.7 
 
 		 339 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  22.05 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  22.17 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  26.26 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0786  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.79 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2808  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  22.05 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1959  hypothetical protein  25.26 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00921  ABC-type Fe3+-siderophore transporter  23.59 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1163  putative vitamin B12 transport protein BtuF  23.35 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.543729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  26.26 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  21.54 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  23 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  30.36 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>