More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_19757 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  100 
 
 
715 aa  1495    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  44.12 
 
 
706 aa  539  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  43.1 
 
 
723 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  42.53 
 
 
765 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  41.99 
 
 
706 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  41.6 
 
 
708 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  41.84 
 
 
721 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  40.38 
 
 
718 aa  500  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  40.55 
 
 
705 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  40.79 
 
 
693 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  40.79 
 
 
686 aa  488  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  39.6 
 
 
694 aa  481  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  41.46 
 
 
708 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  40.11 
 
 
693 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  42.45 
 
 
711 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  40.03 
 
 
694 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  40.11 
 
 
708 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  40.39 
 
 
695 aa  475  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  40.03 
 
 
694 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  40.37 
 
 
671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  39.67 
 
 
756 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  39.59 
 
 
729 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  42.16 
 
 
697 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  41.87 
 
 
696 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  40.87 
 
 
693 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  40.64 
 
 
779 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  40.9 
 
 
720 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  41.15 
 
 
712 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  39.92 
 
 
726 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  42.12 
 
 
712 aa  465  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  40.64 
 
 
666 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  40.11 
 
 
717 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  38.94 
 
 
724 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  40.88 
 
 
722 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  39.32 
 
 
710 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  39.97 
 
 
717 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  39.15 
 
 
707 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  39.92 
 
 
755 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  39.61 
 
 
717 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  39.97 
 
 
717 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  39.47 
 
 
710 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  40.17 
 
 
727 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  40.2 
 
 
711 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  40.17 
 
 
701 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  40.62 
 
 
712 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  39.67 
 
 
758 aa  458  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  40.34 
 
 
711 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  41.38 
 
 
711 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  39.54 
 
 
758 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  40.03 
 
 
727 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  39.79 
 
 
719 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  41.1 
 
 
712 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  41.25 
 
 
719 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  41.3 
 
 
715 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  40.51 
 
 
690 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  39.88 
 
 
774 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  39.34 
 
 
723 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  38.38 
 
 
1464 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  40.99 
 
 
721 aa  452  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  40.74 
 
 
720 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  38.47 
 
 
718 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  39.15 
 
 
738 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  40.23 
 
 
745 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  39.86 
 
 
718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  38.9 
 
 
721 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  42.19 
 
 
1537 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  39.29 
 
 
713 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  39.09 
 
 
752 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  39.31 
 
 
733 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  38.83 
 
 
757 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  41.32 
 
 
727 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  39.48 
 
 
738 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  38.78 
 
 
720 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  39.35 
 
 
705 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  43.78 
 
 
776 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  39.76 
 
 
779 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  39.62 
 
 
701 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  38.88 
 
 
714 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  38.74 
 
 
751 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  40.29 
 
 
683 aa  442  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  38.14 
 
 
712 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  38.88 
 
 
714 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  38.34 
 
 
706 aa  438  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  38.95 
 
 
692 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  38.99 
 
 
729 aa  439  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  38.74 
 
 
714 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  40.47 
 
 
845 aa  438  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  38.98 
 
 
728 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  40.57 
 
 
708 aa  438  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  40.03 
 
 
704 aa  439  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  39.97 
 
 
718 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1785  glycogen debranching enzyme GlgX  40.06 
 
 
691 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  40.97 
 
 
707 aa  433  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  38.23 
 
 
733 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  40.25 
 
 
703 aa  435  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  37.55 
 
 
755 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  40.26 
 
 
720 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  37.79 
 
 
716 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  37.48 
 
 
716 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1735  glycogen debranching enzyme GlgX  39.91 
 
 
691 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>