More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0382 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0382  integrase family protein  100 
 
 		 194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2513  type 1 fimbriae regulatory protein  34.48 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4538  tyrosine recombinase  31.95 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000945122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5818  tyrosine recombinase  31.95 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.855252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4838  tyrosine recombinase  31.95 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3686  integrase family protein  31.95 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2409  integrase family protein  30.18 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1056  integrase family protein  26.6 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0180759 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  31.71 
 
 		 296 aa  85.9  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  29.95 
 
 		 296 aa  85.9  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0366  phage integrase family site specific recombinase  34.01 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.61457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  27.78 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  32.16 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  29.31 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0873  HbiF  29.65 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102979  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0839  DNA recombinase HbiF  29.65 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4235  integrase family protein  32.39 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.407611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0776  hypothetical protein  29.65 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.371446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  27.27 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2871  integrase family protein  29.82 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  28.81 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 296 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  30.86 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  28.57 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0016  Phage integrase  31.01 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0260754  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4785  integrase family protein  29.68 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000301446  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  28.98 
 
 		 309 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  31.67 
 
 		 295 aa  78.2  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2413  integrase family protein  28.14 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  29.12 
 
 		 290 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3710  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  26.88 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04182  tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA  29.82 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04144  hypothetical protein  29.82 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4539  tyrosine recombinase  29.82 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00145575  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4839  tyrosine recombinase  29.82 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  29.35 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  26.82 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.17 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 		 324 aa  75.1  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.49 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  27.72 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 295 aa  75.1  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.26 
 
 		 346 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5819  tyrosine recombinase  29.82 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.97237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 322 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  24.6 
 
 		 302 aa  74.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.65 
 
 		 295 aa  74.3  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  26.47 
 
 		 293 aa  74.7  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  29.79 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  26.29 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  28.24 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  26.67 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  31.76 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  26.06 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  29.89 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  26.47 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3684  integrase family protein  31.97 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  29.31 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  29.09 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0430  site-specific recombinase XerD-like  30.41 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00678047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  29.07 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  29.27 
 
 		 300 aa  72  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  22.7 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 302 aa  71.2  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  25 
 
 		 405 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 		 295 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 295 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.17 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  24.86 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.13 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.98 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.17 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.57 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.12 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0624  integrase family protein  26.09 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  26.32 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  27.03 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.66 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  25 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04141  hypothetical protein  28.95 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  26.7 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  23.3 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  27.49 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>