More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0624 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0624  integrase family protein  100 
 
 		 332 aa  644    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.91 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.91 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.91 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.91 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.91 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.59 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.59 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.59 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.59 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  37.91 
 
 		 290 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.68 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.37 
 
 		 298 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.37 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.02 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  37.37 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  37.02 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.02 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.02 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.02 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.02 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.86 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  51.2 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.95 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.33 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  43.01 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  35.4 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  37.11 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  40.99 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  32.19 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  39.86 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  38.36 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.32 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  48.06 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  41.6 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  33.97 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.86 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  45.96 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  37.41 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  40.89 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  38.56 
 
 		 304 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  40.49 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.86 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.85 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  46.91 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.14 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  31.45 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.81 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  44.85 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.85 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.16 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  40.95 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  37.46 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  44.24 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  40.08 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  36.32 
 
 		 296 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  39.81 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.28 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  40.91 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  37.26 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  40.91 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  41.75 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0194  tyrosine recombinase XerC subunit  38.64 
 
 		 295 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.34 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  39.81 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  40.91 
 
 		 299 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  35 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.52 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  41.21 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  39.9 
 
 		 304 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.12 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  39.81 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  49.13 
 
 		 395 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  36.16 
 
 		 300 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  39.81 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  50.6 
 
 		 329 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  45.78 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  40.82 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  38.61 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.74 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.07 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.69 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.69 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.69 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  37.94 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  40.91 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  47.37 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  33.22 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  38.91 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  42.08 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.07 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  32.2 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  37.81 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  39.02 
 
 		 343 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0902  integrase family protein  38.03 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.46 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.05 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  37 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  39.9 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>