More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1981 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 283 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  61.29 
 
 		 281 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  60.81 
 
 		 310 aa  352  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  57.97 
 
 		 277 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  58.24 
 
 		 305 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  57.61 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  56.47 
 
 		 291 aa  332  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  57.91 
 
 		 282 aa  332  6e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  56.04 
 
 		 279 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  55.71 
 
 		 279 aa  323  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  56.63 
 
 		 292 aa  323  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 		 293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  51.81 
 
 		 286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  51.45 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  48.39 
 
 		 293 aa  280  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  49.06 
 
 		 270 aa  278  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  49.82 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  53.11 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  47.12 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  47.25 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  50.18 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  46.4 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  48.55 
 
 		 301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  49.1 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  46.95 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  48.74 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  46.38 
 
 		 293 aa  254  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  46.3 
 
 		 280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  48.21 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  37.18 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.1 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  38.75 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  35.97 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  32.65 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.65 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.65 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  31.97 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  31.97 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  31.97 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.87 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1784  hypothetical protein  31.03 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  32.11 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  32.11 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  32.11 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 522 aa  62.4  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  32.23 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.39 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  32.23 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  31.9 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  30.7 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  30.28 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  37.8 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>