258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0426 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  41.3 
 
 		 136 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  39.29 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  39.86 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  39.29 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  42.45 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  40.71 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  32.64 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  39.47 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  36.23 
 
 		 140 aa  91.3  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  31.76 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  37.24 
 
 		 182 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  31.29 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  35.97 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  36.43 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  34.46 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  35.51 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  38.76 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  31.47 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  35.17 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  31.08 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  31.33 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  31.21 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  34.78 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  37.24 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  38.76 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  36.55 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  37.98 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  32.61 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.33 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  37.98 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  36.5 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  30.82 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  29.69 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  29.69 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  26.32 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  27.19 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  28.07 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  25.56 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  25.56 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  30.63 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  30.63 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  25.56 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  29.57 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  25.98 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  28.95 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  28.32 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  28.95 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  28 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  29.01 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  24.06 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  29.13 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  29.01 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  28.12 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  29.57 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  28.7 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  27.83 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  25.21 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  27.34 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  26.96 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  23.31 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  27.93 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  27.93 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  27.68 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  28.83 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  28.83 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  27.19 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  28.83 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  28.83 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  28.83 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  28.83 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  24.64 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  25.56 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  24.81 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  26.09 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  24.81 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  24.81 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15678  Plastid ribosomal protein L13 large ribosomal subunit  28.21 
 
 		 218 aa  47.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0368905  hitchhiker  0.00903198 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  29.85 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  24.81 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  27.93 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  27.93 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  28.35 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  27.93 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  27.93 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  27.93 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  26.96 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  25.2 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  26.96 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  27.93 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  24.81 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  27.93 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  31.03 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  26.96 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  25.98 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  27.69 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>