More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0922 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  302  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  77.55 
 
 		 147 aa  244  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  77.55 
 
 		 147 aa  244  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  72.11 
 
 		 147 aa  235  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  74.83 
 
 		 147 aa  234  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 150 aa  231  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  229  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  229  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  226  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 149 aa  226  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  224  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 		 147 aa  224  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  222  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 149 aa  221  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  220  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  219  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  68.71 
 
 		 147 aa  219  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 149 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  215  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  213  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 147 aa  212  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  211  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  68.35 
 
 		 143 aa  209  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  209  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  206  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  65.1 
 
 		 149 aa  204  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  67.14 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  63.27 
 
 		 147 aa  200  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  65.03 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  61.9 
 
 		 147 aa  196  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  61.9 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  61.9 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  61.9 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  64.49 
 
 		 148 aa  193  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  61.49 
 
 		 148 aa  190  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 142 aa  189  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  60 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  57.82 
 
 		 147 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 143 aa  186  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 146 aa  185  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 149 aa  184  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  63.24 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  63.24 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 145 aa  183  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 148 aa  183  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  182  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  182  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  59.15 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  60.74 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  57.24 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>