More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4468 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  299  9e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  229  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  229  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  74.83 
 
 		 147 aa  229  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  74.15 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  226  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  225  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  224  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 		 147 aa  223  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  223  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 147 aa  223  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  223  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 150 aa  221  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  70.75 
 
 		 147 aa  219  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  219  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  217  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 149 aa  216  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  215  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 149 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  67.35 
 
 		 147 aa  212  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  211  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  67.79 
 
 		 149 aa  208  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 147 aa  203  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  64.86 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  65.93 
 
 		 148 aa  190  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 149 aa  185  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  62.24 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  57.24 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 146 aa  183  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 154 aa  183  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 146 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 149 aa  180  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 146 aa  180  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 144 aa  180  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  57.82 
 
 		 147 aa  179  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 149 aa  179  9.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  55.1 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  55.1 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 149 aa  176  8e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  55.1 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  173  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  173  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 149 aa  173  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 149 aa  173  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4113  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 176 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>