More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2680 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  100 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  68.28 
 
 		 147 aa  207  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  71.32 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  71.32 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  67.38 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  68.09 
 
 		 149 aa  200  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  68.09 
 
 		 149 aa  200  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  68.84 
 
 		 145 aa  199  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  65.44 
 
 		 150 aa  196  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  65.71 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  65.94 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  65.94 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  64.49 
 
 		 147 aa  193  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  63.77 
 
 		 147 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  64.49 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  67.41 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  65.93 
 
 		 147 aa  190  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 146 aa  190  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  60.29 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  65.22 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  63.04 
 
 		 147 aa  187  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  65.93 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  63.77 
 
 		 147 aa  187  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  63.97 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  60.29 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  62.22 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  63.77 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  62.96 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  63.04 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  62.32 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  62.32 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  60.74 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 144 aa  182  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 150 aa  182  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  63.04 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  59.26 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  63.24 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  62.32 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  59.15 
 
 		 148 aa  180  7e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 146 aa  180  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  57.82 
 
 		 151 aa  179  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  63.24 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  61.48 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 150 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  56.76 
 
 		 151 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 145 aa  176  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  59.26 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  62.22 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  58.78 
 
 		 151 aa  176  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  58.52 
 
 		 144 aa  176  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  58.99 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  61.48 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  60.74 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  60.74 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>