More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0726 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 143 aa  300  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  70.21 
 
 		 143 aa  213  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  70.63 
 
 		 144 aa  211  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  73.19 
 
 		 142 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  68.31 
 
 		 144 aa  203  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  67.63 
 
 		 145 aa  199  9e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 151 aa  196  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 142 aa  194  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 148 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 144 aa  193  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 144 aa  193  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000697609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  65.94 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  65.94 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  66.19 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  64.29 
 
 		 145 aa  189  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 151 aa  185  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 151 aa  185  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  62.68 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  63.24 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 147 aa  176  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 147 aa  176  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 147 aa  176  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  63.97 
 
 		 146 aa  174  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 176 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 147 aa  173  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 147 aa  173  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 147 aa  173  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 144 aa  173  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 151 aa  173  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 143 aa  173  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 176 aa  173  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 170 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>