More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1319 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  100 
 
 		 149 aa  306  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  79.87 
 
 		 151 aa  248  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  77.55 
 
 		 151 aa  242  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  75.68 
 
 		 151 aa  241  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  73.97 
 
 		 151 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  73.97 
 
 		 151 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  73.15 
 
 		 151 aa  234  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2985  50S ribosomal protein L13  73.83 
 
 		 151 aa  227  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  68.28 
 
 		 150 aa  218  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  68.28 
 
 		 150 aa  218  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  64.43 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  65.52 
 
 		 170 aa  210  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  65.1 
 
 		 150 aa  210  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  69.01 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  65.1 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  68.31 
 
 		 143 aa  208  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 		 143 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  61.11 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  59.31 
 
 		 147 aa  186  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  186  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  58.16 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 149 aa  177  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 148 aa  173  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  55.17 
 
 		 147 aa  173  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 146 aa  173  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 151 aa  170  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 147 aa  169  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  57.24 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  57.24 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 145 aa  167  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>