More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0617 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  84.35 
 
 		 149 aa  262  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  83.67 
 
 		 147 aa  261  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  79.59 
 
 		 147 aa  254  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  80.27 
 
 		 147 aa  253  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  76.87 
 
 		 147 aa  246  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  76.87 
 
 		 147 aa  244  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  76.87 
 
 		 147 aa  244  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  76.19 
 
 		 147 aa  244  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  73.47 
 
 		 147 aa  234  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  232  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 149 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  230  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  73.15 
 
 		 149 aa  229  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 147 aa  229  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  223  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  223  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  215  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 150 aa  214  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  210  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  209  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  209  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  207  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  206  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  63.27 
 
 		 147 aa  203  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 146 aa  199  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  60.54 
 
 		 149 aa  199  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 149 aa  196  7e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 146 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 148 aa  194  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  54.48 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  55.78 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 176 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4113  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  176  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>