More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0429 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  100 
 
 
154 aa  314  3e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  65.69 
 
 
147 aa  201  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  67.15 
 
 
147 aa  201  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  60.56 
 
 
144 aa  197  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  58.33 
 
 
148 aa  197  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  60.56 
 
 
145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  65.22 
 
 
146 aa  195  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  194  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  61.11 
 
 
147 aa  194  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  61.81 
 
 
147 aa  194  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  193  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  63.38 
 
 
149 aa  192  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  64.54 
 
 
145 aa  192  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 
151 aa  192  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  61.81 
 
 
147 aa  192  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  61.74 
 
 
149 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
144 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 
147 aa  192  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  191  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  191  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  191  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  60.42 
 
 
147 aa  190  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
147 aa  190  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  189  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
144 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  62.33 
 
 
149 aa  188  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  61.64 
 
 
149 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  188  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 
147 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  58.67 
 
 
150 aa  187  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 
147 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 
147 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 
147 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 
147 aa  187  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  186  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
148 aa  185  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  56.94 
 
 
147 aa  185  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.99 
 
 
146 aa  185  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
150 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 
146 aa  185  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  184  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  184  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  59.72 
 
 
147 aa  183  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  183  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  183  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  183  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  183  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  183  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
144 aa  183  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  183  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  58.33 
 
 
147 aa  183  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  57.64 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
176 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
144 aa  181  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  58.5 
 
 
150 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  181  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 
151 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
144 aa  181  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
146 aa  181  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  58.5 
 
 
150 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  181  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 
151 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 
150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  58.16 
 
 
150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>