More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01710 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  100 
 
 		 148 aa  304  3e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  83.8 
 
 		 144 aa  256  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  79.17 
 
 		 145 aa  246  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 146 aa  207  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 154 aa  197  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  62.77 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 150 aa  191  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  189  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  61.11 
 
 		 147 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  62.77 
 
 		 147 aa  187  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 145 aa  183  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 147 aa  183  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 151 aa  183  8e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 147 aa  183  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 146 aa  183  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 146 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 149 aa  180  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 148 aa  180  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 151 aa  180  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 144 aa  180  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 151 aa  179  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 146 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 148 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 161 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 147 aa  176  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 147 aa  176  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 176 aa  176  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 144 aa  176  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 147 aa  176  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  61.48 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>