More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0005 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  303  7e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  70.92 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  65.03 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 151 aa  191  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 149 aa  191  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  64.29 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  64.29 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  61.11 
 
 		 148 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 145 aa  186  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  60.99 
 
 		 145 aa  183  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 149 aa  183  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  65.22 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  62.77 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  58.5 
 
 		 150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  56.46 
 
 		 149 aa  180  6e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 163 aa  180  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 143 aa  180  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 154 aa  179  8.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  63.83 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  63.24 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 143 aa  176  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  61.76 
 
 		 148 aa  176  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 145 aa  176  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  65.96 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  175  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  65.96 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 176 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  60.29 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  64.44 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  56.46 
 
 		 151 aa  174  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 176 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  63.24 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  60.29 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>