More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0735 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  69.5 
 
 		 144 aa  209  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  67.38 
 
 		 144 aa  203  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  66.9 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 144 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  65.96 
 
 		 144 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  67.14 
 
 		 147 aa  201  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  67.86 
 
 		 142 aa  200  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  67.86 
 
 		 142 aa  200  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  65.96 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  66.43 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 150 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  65.25 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  65.25 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  64.29 
 
 		 150 aa  194  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  63.83 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  65.25 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  65.25 
 
 		 142 aa  193  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  65.96 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 147 aa  192  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 154 aa  192  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 149 aa  191  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  189  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 150 aa  186  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 147 aa  186  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  64.75 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>