More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3996 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  96.58 
 
 		 146 aa  293  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  76.92 
 
 		 143 aa  234  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  68.57 
 
 		 144 aa  215  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  64.54 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 146 aa  197  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 149 aa  197  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 147 aa  194  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  193  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  193  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  61.31 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  60.14 
 
 		 145 aa  187  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 142 aa  186  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 142 aa  185  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 147 aa  185  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  62.32 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 150 aa  184  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 145 aa  183  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  56.93 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  56.03 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 145 aa  180  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 150 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 150 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 147 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  55.8 
 
 		 148 aa  179  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  58.99 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>