More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0138 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  98.62 
 
 
145 aa  297  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  95.86 
 
 
145 aa  293  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  95.17 
 
 
145 aa  290  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  82.76 
 
 
145 aa  253  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  77.24 
 
 
145 aa  244  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 
145 aa  215  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 
145 aa  215  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 
145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
143 aa  192  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  64.29 
 
 
144 aa  191  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
143 aa  188  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  61.81 
 
 
148 aa  188  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 
144 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 
147 aa  188  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 
147 aa  187  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  61.81 
 
 
148 aa  187  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  60.69 
 
 
148 aa  186  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 
146 aa  186  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
144 aa  186  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 
143 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 
142 aa  184  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  184  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  184  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 
142 aa  184  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  184  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 
142 aa  184  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  183  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 
146 aa  183  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  183  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  60.71 
 
 
142 aa  183  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 
144 aa  183  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 
149 aa  182  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 
149 aa  182  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  61.59 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  59.29 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  181  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  59.29 
 
 
145 aa  181  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  60 
 
 
145 aa  181  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 
143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  180  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  180  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
143 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
143 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 
145 aa  179  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 
144 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 
142 aa  179  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  178  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  178  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 
144 aa  178  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  57.86 
 
 
154 aa  178  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  58.57 
 
 
148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 
151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 
147 aa  177  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 
147 aa  177  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
143 aa  177  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 
142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  55.71 
 
 
146 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
142 aa  176  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  59.56 
 
 
142 aa  176  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  57.75 
 
 
144 aa  176  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
142 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
176 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
142 aa  176  7e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>