More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2584 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  85.81 
 
 		 148 aa  270  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  84.46 
 
 		 148 aa  268  2.9999999999999997e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 148 aa  207  4e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  63.27 
 
 		 147 aa  207  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  65.52 
 
 		 145 aa  204  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  65.52 
 
 		 145 aa  204  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 145 aa  196  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  62.07 
 
 		 145 aa  189  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  60.69 
 
 		 145 aa  186  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  57.93 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  60.84 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  57.93 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  55.7 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 147 aa  173  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 149 aa  170  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 151 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 149 aa  170  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 143 aa  170  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  57.14 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 151 aa  166  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 151 aa  166  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 150 aa  166  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>