More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1346 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  68.06 
 
 		 163 aa  215  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  69.13 
 
 		 147 aa  207  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  70.92 
 
 		 142 aa  207  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  70 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  70 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  68.09 
 
 		 148 aa  200  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  65.94 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  65.25 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 142 aa  194  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 147 aa  193  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  65.25 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  65.03 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 145 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  63.24 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 145 aa  182  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  65.44 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  61.7 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 148 aa  180  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  60.28 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 147 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2727  ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000734549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  65.96 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  61.76 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  62.79 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>