More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0434 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  69.13 
 
 		 149 aa  207  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  69.13 
 
 		 149 aa  207  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  65.77 
 
 		 163 aa  206  8e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  63.16 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  60.15 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  58.14 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  59.84 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  60.31 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  60.31 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  58.78 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  61.65 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200743  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  60.31 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  56.16 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  55.4 
 
 		 146 aa  170  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  61.65 
 
 		 144 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000697609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  60.15 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  59.4 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  60.15 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  61.36 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  53.96 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 145 aa  166  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  56.06 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 150 aa  165  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  60.94 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  59.06 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  55.3 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 170 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  56.49 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  55.64 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  55.3 
 
 		 147 aa  163  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  56.39 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  55.3 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  54.89 
 
 		 147 aa  163  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 154 aa  162  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  55.3 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 147 aa  162  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  56.39 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  55.64 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  56.39 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  55.3 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  55.32 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  52.63 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  55.64 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  51.88 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  58.46 
 
 		 151 aa  161  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf386  50S ribosomal protein L13  56.82 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.112252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  54.62 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2985  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  54.62 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  54.89 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  57.81 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  55.3 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  55.3 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>