More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2679 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  99.31 
 
 		 144 aa  293  5e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000697609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  69.72 
 
 		 144 aa  209  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  68.09 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 		 143 aa  193  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  68.09 
 
 		 145 aa  193  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 143 aa  182  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  63.31 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 147 aa  173  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 147 aa  173  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 144 aa  173  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 147 aa  173  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 149 aa  170  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  61.65 
 
 		 147 aa  170  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  61.48 
 
 		 148 aa  169  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  54.93 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 146 aa  166  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  57.66 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  56.34 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 148 aa  163  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>