More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2614 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 149 aa  303  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  83.89 
 
 		 149 aa  271  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  81.63 
 
 		 147 aa  258  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  82.99 
 
 		 147 aa  255  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  76.19 
 
 		 147 aa  248  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  74.83 
 
 		 147 aa  241  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 147 aa  231  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 147 aa  229  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  75.51 
 
 		 150 aa  228  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  228  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  228  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  70.07 
 
 		 147 aa  226  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 147 aa  226  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  70.47 
 
 		 149 aa  226  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  225  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 		 147 aa  225  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 		 147 aa  224  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  223  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  69.39 
 
 		 147 aa  220  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  220  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  69.8 
 
 		 149 aa  219  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 		 147 aa  217  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  216  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  214  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  213  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 147 aa  207  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  65.54 
 
 		 148 aa  203  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  63.27 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  63.27 
 
 		 147 aa  201  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  61.9 
 
 		 147 aa  199  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  65.47 
 
 		 143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  65.25 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  61.64 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  61.74 
 
 		 154 aa  192  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  58.62 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  65.25 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  65.69 
 
 		 148 aa  190  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 144 aa  190  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 144 aa  190  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 145 aa  189  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  60.58 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  56.38 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  64.96 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  56.38 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 148 aa  181  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4113  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>