More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2298 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
144 aa  297  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  70.42 
 
 
142 aa  217  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  70.42 
 
 
142 aa  217  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  67.13 
 
 
144 aa  215  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  70.5 
 
 
143 aa  208  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  69.01 
 
 
144 aa  205  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 
142 aa  204  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  66.9 
 
 
147 aa  203  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  68.12 
 
 
143 aa  202  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  67.15 
 
 
143 aa  201  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 
147 aa  200  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 
147 aa  200  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  64.23 
 
 
147 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  65.96 
 
 
145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  63.38 
 
 
148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  64.23 
 
 
147 aa  197  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  65.69 
 
 
150 aa  196  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
147 aa  196  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 
142 aa  194  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  61.27 
 
 
149 aa  194  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 
149 aa  193  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  62.77 
 
 
145 aa  192  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 
143 aa  192  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
149 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  66.21 
 
 
145 aa  191  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  60.14 
 
 
142 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  62.77 
 
 
149 aa  191  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  192  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  65.52 
 
 
145 aa  191  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  59.86 
 
 
147 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 
149 aa  190  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  190  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 
144 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 
144 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000697609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  64.14 
 
 
145 aa  190  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
147 aa  190  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 
142 aa  189  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
145 aa  188  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 
145 aa  188  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  188  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  62.32 
 
 
142 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  61.31 
 
 
149 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  59.44 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 
145 aa  187  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  62.68 
 
 
147 aa  187  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 
145 aa  187  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 
145 aa  187  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 
145 aa  187  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 
145 aa  187  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 
145 aa  187  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 
145 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 
145 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  186  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  62.96 
 
 
148 aa  186  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  59.86 
 
 
145 aa  186  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
150 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  59.15 
 
 
147 aa  186  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 
149 aa  185  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 
149 aa  185  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  61.31 
 
 
149 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 
144 aa  185  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
147 aa  185  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 
142 aa  184  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  184  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  184  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 
147 aa  184  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
142 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  183  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  59.12 
 
 
147 aa  183  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
142 aa  183  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  58.45 
 
 
154 aa  183  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  63.04 
 
 
142 aa  183  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
144 aa  183  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  57.04 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  59.15 
 
 
149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  58.74 
 
 
145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
142 aa  181  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  181  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  58.04 
 
 
144 aa  181  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  59.86 
 
 
147 aa  181  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 
147 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  55.94 
 
 
147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>