More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21990 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  100 
 
 		 145 aa  296  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  79.17 
 
 		 148 aa  246  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  81.12 
 
 		 144 aa  245  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  69.5 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  62.07 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  60 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  59.31 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  60.69 
 
 		 147 aa  193  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 147 aa  193  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  62.32 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  61.11 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 151 aa  188  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  60.69 
 
 		 150 aa  187  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  57.93 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  56.55 
 
 		 147 aa  185  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 148 aa  184  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  57.24 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 147 aa  183  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  60.69 
 
 		 146 aa  184  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 147 aa  183  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  182  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 161 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4113  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  57.24 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  55.86 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 176 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 144 aa  179  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 148 aa  179  8.000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  55.17 
 
 		 147 aa  179  8.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 143 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>