More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3106 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  304  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  80.27 
 
 		 147 aa  253  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  78.23 
 
 		 147 aa  249  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  78.23 
 
 		 147 aa  247  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  76.87 
 
 		 149 aa  245  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  76.87 
 
 		 147 aa  244  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  74.15 
 
 		 147 aa  241  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  77.55 
 
 		 147 aa  241  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  76.19 
 
 		 147 aa  240  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  76.19 
 
 		 147 aa  238  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  74.83 
 
 		 147 aa  235  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  74.15 
 
 		 147 aa  235  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  74.15 
 
 		 150 aa  234  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  73.47 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  74.15 
 
 		 147 aa  235  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  74.83 
 
 		 147 aa  234  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  233  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 147 aa  231  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 149 aa  229  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  73.15 
 
 		 149 aa  228  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 147 aa  226  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  223  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 		 147 aa  221  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  220  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  216  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  215  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  213  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  212  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  63.27 
 
 		 149 aa  207  5e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 147 aa  206  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  63.27 
 
 		 149 aa  206  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  203  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  199  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  64.03 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  61.11 
 
 		 154 aa  194  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  193  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 144 aa  193  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  58.62 
 
 		 145 aa  193  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  60.69 
 
 		 146 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 146 aa  190  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  189  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  61.49 
 
 		 148 aa  188  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  63.77 
 
 		 148 aa  187  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4113  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>