More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0969 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 144 aa  300  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  83.33 
 
 		 144 aa  253  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  82.39 
 
 		 144 aa  251  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  77.78 
 
 		 144 aa  243  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  67.38 
 
 		 145 aa  203  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  65 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 147 aa  197  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 161 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  195  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 148 aa  191  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 143 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  190  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 147 aa  190  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 176 aa  190  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 146 aa  189  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  59.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>