More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1528 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  100 
 
 		 145 aa  296  5e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  67.14 
 
 		 142 aa  200  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  67.14 
 
 		 142 aa  200  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  66.91 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 149 aa  189  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 149 aa  189  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  63.83 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 151 aa  184  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 147 aa  183  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  59.56 
 
 		 147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  179  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  176  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  176  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  175  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000697609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 146 aa  173  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 144 aa  173  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 144 aa  173  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  54.61 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 170 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 146 aa  173  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  54.61 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  55.32 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  58.16 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>