More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  100 
 
 		 149 aa  306  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  77.85 
 
 		 147 aa  237  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  77.85 
 
 		 147 aa  236  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  75.17 
 
 		 147 aa  234  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  75.17 
 
 		 147 aa  233  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  73.15 
 
 		 147 aa  229  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  74.5 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  73.15 
 
 		 147 aa  228  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  73.83 
 
 		 149 aa  227  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  73.15 
 
 		 147 aa  225  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  73.15 
 
 		 147 aa  220  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  69.8 
 
 		 149 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  69.13 
 
 		 149 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  69.8 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  69.8 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  71.81 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  70.47 
 
 		 147 aa  216  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  70.47 
 
 		 147 aa  215  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  70.47 
 
 		 147 aa  215  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  68.46 
 
 		 147 aa  210  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  66.44 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  67.11 
 
 		 150 aa  209  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  67.79 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  68.46 
 
 		 147 aa  206  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  65.1 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  65.77 
 
 		 147 aa  203  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  66.44 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  66.44 
 
 		 147 aa  200  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  66.44 
 
 		 147 aa  200  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  65.1 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 148 aa  197  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  64.43 
 
 		 147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  65.1 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  65.1 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  65.1 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  62.42 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  61.74 
 
 		 149 aa  192  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  62.33 
 
 		 154 aa  188  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  59.73 
 
 		 149 aa  187  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  62.31 
 
 		 144 aa  179  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  58.5 
 
 		 146 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  55.78 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  65.38 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 145 aa  174  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  59.03 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  59.03 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  54.79 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4113  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  60.77 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  60.77 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 176 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  54.79 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  57.05 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 176 aa  170  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  60.16 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  54.11 
 
 		 148 aa  170  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 144 aa  170  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  55.48 
 
 		 151 aa  170  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  56.38 
 
 		 147 aa  170  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>