More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2994 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  76.92 
 
 		 146 aa  234  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  76.22 
 
 		 146 aa  233  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  67.86 
 
 		 144 aa  210  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  65.71 
 
 		 147 aa  200  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  65.94 
 
 		 149 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  65.94 
 
 		 149 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  64.29 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  65.22 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  65.22 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  65.71 
 
 		 146 aa  196  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 		 147 aa  194  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 		 147 aa  194  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  63.57 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  65.71 
 
 		 148 aa  194  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 		 149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 149 aa  191  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  63.04 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 147 aa  191  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  60 
 
 		 147 aa  191  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  64.49 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  64.49 
 
 		 142 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 142 aa  186  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  63.04 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  58.57 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  62.32 
 
 		 142 aa  185  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  61.76 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  60 
 
 		 147 aa  184  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  61.31 
 
 		 145 aa  183  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  59.42 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  62.32 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  55.8 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  60.61 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 150 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 144 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000697609  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 147 aa  176  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  59.09 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>