More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0222 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  82.12 
 
 		 151 aa  265  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  75.5 
 
 		 151 aa  244  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  72.19 
 
 		 151 aa  241  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  73.33 
 
 		 151 aa  239  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  73.97 
 
 		 149 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2985  50S ribosomal protein L13  74.67 
 
 		 151 aa  234  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  73.76 
 
 		 143 aa  227  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 150 aa  226  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  70.34 
 
 		 170 aa  226  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 150 aa  226  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  73.05 
 
 		 143 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  72.34 
 
 		 143 aa  224  4e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  68.06 
 
 		 150 aa  223  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  71.63 
 
 		 143 aa  222  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  67.36 
 
 		 150 aa  215  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  59.72 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  186  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 		 143 aa  184  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  61.76 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  61.87 
 
 		 142 aa  182  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 154 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  60.29 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  180  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 149 aa  180  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  58.99 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 144 aa  176  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  57.55 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  58.99 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  58.99 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  57.55 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>