More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf386 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf386  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
144 aa  296  5e-80  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.112252  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 
147 aa  175  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 
148 aa  167  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 
148 aa  165  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  50.69 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  50.69 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  56.82 
 
 
147 aa  161  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  160  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 
145 aa  160  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  52.17 
 
 
150 aa  159  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  52.17 
 
 
150 aa  159  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  53.19 
 
 
147 aa  159  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  52.82 
 
 
150 aa  159  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 
143 aa  158  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  48.61 
 
 
145 aa  158  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  56.34 
 
 
151 aa  159  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 
149 aa  158  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 
148 aa  158  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  51.45 
 
 
170 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  51.8 
 
 
148 aa  157  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
149 aa  157  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
149 aa  157  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 
163 aa  156  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  48.25 
 
 
150 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 
154 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  50.69 
 
 
145 aa  155  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  52.94 
 
 
144 aa  156  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  47.55 
 
 
150 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  54.61 
 
 
147 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 
158 aa  155  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  51.41 
 
 
147 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
151 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  47.55 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  53.42 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  48.25 
 
 
143 aa  153  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 
144 aa  154  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
142 aa  153  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  52.9 
 
 
151 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
143 aa  153  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 
146 aa  153  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  52.9 
 
 
151 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 
144 aa  153  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  55.32 
 
 
147 aa  153  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  51.45 
 
 
143 aa  153  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 
147 aa  153  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 
156 aa  152  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  52.82 
 
 
156 aa  152  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 
145 aa  152  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  54.07 
 
 
143 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  152  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 
143 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
142 aa  151  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  151  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  51.39 
 
 
145 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 
145 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  48.92 
 
 
143 aa  151  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
156 aa  152  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 
154 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 
147 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 
147 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 
154 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  51.47 
 
 
146 aa  151  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  47.48 
 
 
143 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  54.74 
 
 
153 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
142 aa  151  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  49.3 
 
 
147 aa  150  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  54.96 
 
 
147 aa  150  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
142 aa  150  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  51.91 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
151 aa  150  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  48.2 
 
 
143 aa  150  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  48.95 
 
 
143 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 
154 aa  150  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  149  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  52.48 
 
 
149 aa  149  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  50.71 
 
 
142 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  52.82 
 
 
146 aa  149  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  50.75 
 
 
142 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>