More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0801 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 151 aa  309  7.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  60.84 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.09 
 
 		 146 aa  187  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 146 aa  183  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  60 
 
 		 148 aa  183  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 146 aa  183  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 163 aa  178  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  55.88 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 144 aa  173  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  52.24 
 
 		 150 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 144 aa  173  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 144 aa  173  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  50 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 151 aa  173  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  54.74 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 149 aa  173  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 151 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 151 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 151 aa  170  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  48.95 
 
 		 149 aa  171  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 149 aa  170  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 149 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 147 aa  170  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 147 aa  170  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 147 aa  170  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  48.25 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 144 aa  166  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 148 aa  166  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>