More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0904 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 142 aa  293  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  76.76 
 
 		 142 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  77.46 
 
 		 142 aa  233  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  75.35 
 
 		 142 aa  233  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  75.35 
 
 		 142 aa  227  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  75.35 
 
 		 142 aa  226  6e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  73.94 
 
 		 142 aa  225  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  75.35 
 
 		 142 aa  226  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  224  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  222  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  222  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  72.14 
 
 		 143 aa  222  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  222  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  73.94 
 
 		 142 aa  222  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  223  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  74.65 
 
 		 142 aa  221  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  72.14 
 
 		 143 aa  221  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  73.94 
 
 		 142 aa  222  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  76.06 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  221  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  220  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  221  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  221  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  221  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  220  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  221  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  220  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  72.14 
 
 		 143 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  220  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  220  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  71.13 
 
 		 142 aa  220  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  71.13 
 
 		 142 aa  220  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  219  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  70.42 
 
 		 142 aa  219  8e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  219  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  71.83 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  71.83 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  71.83 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  71.13 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  71.83 
 
 		 142 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  71.83 
 
 		 142 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  71.83 
 
 		 142 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  217  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  71.13 
 
 		 142 aa  217  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  71.83 
 
 		 142 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  71.13 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  70.42 
 
 		 142 aa  214  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  71.13 
 
 		 142 aa  213  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  70 
 
 		 143 aa  213  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 144 aa  212  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 		 142 aa  211  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  73.24 
 
 		 144 aa  212  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  69.01 
 
 		 142 aa  210  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  69.01 
 
 		 142 aa  207  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  68.31 
 
 		 142 aa  207  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  68.31 
 
 		 142 aa  206  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  69.72 
 
 		 142 aa  206  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  69.01 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  69.01 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  66.9 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 		 148 aa  202  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  66.9 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  66.9 
 
 		 142 aa  200  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  66.9 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  66.9 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 144 aa  197  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 176 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>