More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3039 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  309  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 150 aa  223  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  61.22 
 
 		 147 aa  213  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  61.22 
 
 		 147 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 151 aa  208  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 		 151 aa  207  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 149 aa  197  3e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 151 aa  193  7e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 145 aa  190  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  54.42 
 
 		 147 aa  187  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  57.82 
 
 		 151 aa  186  5.999999999999999e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 145 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 145 aa  176  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  52.7 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 151 aa  173  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 144 aa  173  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  51.72 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  53.33 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 187 aa  167  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  54.61 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 149 aa  166  9e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  52.38 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  51.35 
 
 		 159 aa  163  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>