More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0110 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 150 aa  240  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  228  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 151 aa  219  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 149 aa  214  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  61.22 
 
 		 147 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 151 aa  207  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  59.18 
 
 		 151 aa  201  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 		 151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  59.31 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  53.1 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  54.42 
 
 		 147 aa  170  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  52.41 
 
 		 149 aa  170  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 150 aa  169  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  52.7 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 154 aa  166  9e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  55.88 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  51.03 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  51.72 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  50.34 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 143 aa  163  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 		 146 aa  163  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 187 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  51.05 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>