More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1178 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 153 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  92.16 
 
 		 153 aa  299  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  90.85 
 
 		 153 aa  293  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  90.85 
 
 		 153 aa  293  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  87.58 
 
 		 153 aa  285  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  86.27 
 
 		 153 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  78.15 
 
 		 153 aa  255  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  75.82 
 
 		 154 aa  246  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  78.52 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  76.47 
 
 		 154 aa  244  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  76.47 
 
 		 154 aa  244  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  74.51 
 
 		 154 aa  244  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  75.84 
 
 		 156 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  75.82 
 
 		 154 aa  243  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  74.51 
 
 		 154 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  75.16 
 
 		 154 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  74 
 
 		 153 aa  237  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  72.55 
 
 		 154 aa  237  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  73.2 
 
 		 154 aa  236  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  74 
 
 		 154 aa  234  4e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  74 
 
 		 154 aa  233  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  74 
 
 		 154 aa  233  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  72.55 
 
 		 154 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  70.59 
 
 		 154 aa  229  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  72.67 
 
 		 154 aa  230  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  70.86 
 
 		 187 aa  229  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  68.24 
 
 		 159 aa  220  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 159 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  66.01 
 
 		 154 aa  218  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 152 aa  217  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  65.36 
 
 		 158 aa  216  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  69.08 
 
 		 160 aa  214  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  66.23 
 
 		 164 aa  211  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  63.4 
 
 		 152 aa  210  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  65.13 
 
 		 154 aa  210  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 157 aa  205  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  63.4 
 
 		 154 aa  203  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  63.4 
 
 		 154 aa  203  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  62.75 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  62 
 
 		 152 aa  199  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  63.33 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  56.67 
 
 		 156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  58 
 
 		 152 aa  177  2.9999999999999997e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 150 aa  170  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  170  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 145 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 149 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 147 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 145 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>