More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4741 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  307  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  75.51 
 
 		 150 aa  249  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  228  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 151 aa  213  5e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  61.22 
 
 		 147 aa  213  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 149 aa  211  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 151 aa  204  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  62.07 
 
 		 151 aa  201  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  60.54 
 
 		 151 aa  196  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  55.1 
 
 		 147 aa  179  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 187 aa  176  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  175  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  175  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  175  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  54.79 
 
 		 159 aa  174  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 145 aa  173  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 149 aa  170  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 149 aa  170  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 149 aa  170  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 149 aa  170  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  56.3 
 
 		 145 aa  166  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 154 aa  166  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 154 aa  166  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  55.4 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  164  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  51.72 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  52.41 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 		 144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 157 aa  163  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  51.05 
 
 		 148 aa  163  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  63.41 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  51.77 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  52.41 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  54.07 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  57.35 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>