More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1612 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 151 aa  310  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  69.54 
 
 		 151 aa  222  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  69.33 
 
 		 151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  63.58 
 
 		 151 aa  213  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 150 aa  207  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 147 aa  207  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  60.54 
 
 		 147 aa  196  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  59.18 
 
 		 149 aa  193  7e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  57.82 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  56.46 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  52.32 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 145 aa  169  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 150 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 153 aa  163  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 170 aa  163  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  50.34 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  51.7 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 144 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 144 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  51.72 
 
 		 149 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  51.66 
 
 		 159 aa  160  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  51.7 
 
 		 151 aa  158  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  54.41 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  52.41 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  50.34 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 148 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  52.24 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  52.41 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  50.35 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  50 
 
 		 144 aa  157  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  49.31 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  51.39 
 
 		 151 aa  156  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 145 aa  157  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  51.72 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  51.39 
 
 		 151 aa  156  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>