More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2649 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  98.04 
 
 		 153 aa  309  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  98.04 
 
 		 153 aa  309  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  92.16 
 
 		 153 aa  299  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  91.5 
 
 		 153 aa  292  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  90.2 
 
 		 153 aa  289  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  77.48 
 
 		 153 aa  254  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  77.85 
 
 		 156 aa  247  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  75.82 
 
 		 154 aa  247  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  79.87 
 
 		 156 aa  246  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  76.47 
 
 		 154 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  75.16 
 
 		 154 aa  243  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  74.51 
 
 		 154 aa  243  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  75.16 
 
 		 154 aa  243  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  75.82 
 
 		 154 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  75.16 
 
 		 154 aa  240  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  72.55 
 
 		 154 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  73.33 
 
 		 153 aa  231  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  72.67 
 
 		 154 aa  228  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  71.24 
 
 		 154 aa  228  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  70.59 
 
 		 154 aa  228  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  72.67 
 
 		 154 aa  226  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  72.67 
 
 		 154 aa  226  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  72 
 
 		 154 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  69.54 
 
 		 187 aa  225  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  69.28 
 
 		 154 aa  224  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  69.59 
 
 		 159 aa  220  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  67.32 
 
 		 158 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 159 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  64.47 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  65.36 
 
 		 152 aa  214  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  69.08 
 
 		 154 aa  214  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  65.36 
 
 		 154 aa  213  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  68.24 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  66.23 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  65.13 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  62.09 
 
 		 152 aa  205  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  63.4 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  63.4 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  63.58 
 
 		 154 aa  200  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  61.33 
 
 		 152 aa  197  5e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  62 
 
 		 154 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  56.67 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 163 aa  167  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 144 aa  167  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  167  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 147 aa  166  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  55.41 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>