More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4595 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 159 aa  327  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  79.87 
 
 		 159 aa  271  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  73.58 
 
 		 159 aa  250  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  70.2 
 
 		 153 aa  227  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  69.54 
 
 		 153 aa  226  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  69.18 
 
 		 153 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  69.59 
 
 		 156 aa  223  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  67.55 
 
 		 153 aa  221  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  67.55 
 
 		 153 aa  221  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  70.63 
 
 		 154 aa  220  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  67.79 
 
 		 154 aa  217  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  69.23 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  67.57 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  65.56 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  65.16 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  66.23 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  68.21 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 154 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 154 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 154 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  65.13 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  64.86 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  64.9 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  63.58 
 
 		 154 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 153 aa  207  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 152 aa  200  5e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  61.18 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  58.94 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  61.18 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  57.42 
 
 		 160 aa  197  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  62.16 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  62.16 
 
 		 164 aa  195  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 154 aa  194  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  60.81 
 
 		 152 aa  192  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  59.46 
 
 		 152 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 148 aa  167  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  52.38 
 
 		 147 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  57.45 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  51.35 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  51.39 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  51.37 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  49.66 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  160  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>