117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0635 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  84.13 
 
 		 137 aa  224  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  84.92 
 
 		 137 aa  223  9e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  82.54 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  72.06 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  47.55 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  46.15 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  46.85 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  48.98 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  45.45 
 
 		 139 aa  123  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  46.67 
 
 		 179 aa  120  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  43.92 
 
 		 140 aa  116  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  42.86 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  41.96 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  45.39 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  42.47 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  45.07 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  43.36 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  41.13 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  43.93 
 
 		 186 aa  100  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  41.12 
 
 		 185 aa  94  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  37.41 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  42.06 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  39.29 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  39.86 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  40.19 
 
 		 186 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  38.13 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  38.46 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  33.56 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  33.78 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  27.82 
 
 		 199 aa  63.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  33.98 
 
 		 201 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  34.34 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  33.91 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  35.34 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  31.93 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  28.68 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0663  50S ribosomal protein L13  33.62 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.131584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  29.51 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  30.17 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  30.25 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  31.36 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  33.66 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  31.09 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  31.93 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  30.17 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  28.45 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  28.45 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  29.2 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  32.76 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  24.78 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  29.29 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  28.7 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  31.58 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  31 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  31.68 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  29.66 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  29.31 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  32.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  32.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  32.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  32.2 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  26.89 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  32.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  32.2 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  28.7 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  28.8 
 
 		 149 aa  42  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  27.87 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  32.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  32.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  32.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  32.2 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  25.25 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  31 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  28.21 
 
 		 151 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  29.2 
 
 		 142 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  31.9 
 
 		 142 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  32.2 
 
 		 143 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  32.23 
 
 		 150 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  32.2 
 
 		 143 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  31.07 
 
 		 147 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  31.36 
 
 		 151 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  31.36 
 
 		 151 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  28.81 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  29.66 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  31.09 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  26.09 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  25.42 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  28.68 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  30.4 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  31.36 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  27.05 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  29.31 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>