More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0425 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  87.16 
 
 		 149 aa  271  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  76.35 
 
 		 148 aa  234  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  72.97 
 
 		 146 aa  226  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  70.27 
 
 		 149 aa  218  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  48.55 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  47.45 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  49.64 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  46.32 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  46.72 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  47.83 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  44.53 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  45.65 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  46.38 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  43.97 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  46.97 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  45.59 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  45.86 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  35.97 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  46.21 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  42.55 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  39.47 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  38.73 
 
 		 185 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  37.09 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  37.59 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  31.29 
 
 		 200 aa  85.5  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  38.73 
 
 		 186 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  35.17 
 
 		 182 aa  84.3  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.33 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  38.89 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  30.41 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  32.37 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  29.14 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  35.43 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  32.56 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  31.01 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  33.59 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  31.43 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  30 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  30.71 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  30.71 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  33.93 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  33.08 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  33.63 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  33.07 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  31.01 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  30.4 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  29.13 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  32.2 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  30 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  30.4 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  30.95 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  30.4 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  32.76 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  32.82 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  30.2 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  29.23 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  35.65 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  32.31 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  28.15 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  32.86 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  32.77 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  28.15 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  33.08 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_014150  Bmur_0971  ribosomal protein L13  31.15 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  8.8963e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  31.01 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  28.15 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  29.31 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  32.33 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  29.57 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  29.31 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  31.5 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  32.06 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  32.56 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  29.23 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  31.67 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  29.63 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  34.13 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  30.47 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  29.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  29.31 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  30.6 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  34.13 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  28.06 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  28.7 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  28.7 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  30.43 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  28.7 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  28.28 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  30.97 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  28.7 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  28.7 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>