More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0971 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0971  ribosomal protein L13  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  8.8963e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  52.86 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  48.57 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 149 aa  159  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 149 aa  159  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  53.96 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  51.43 
 
 		 147 aa  157  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 144 aa  156  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  156  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 147 aa  156  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  46.81 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  47.14 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  46.81 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  48.89 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  48.89 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  46.81 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  49.32 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  47.14 
 
 		 142 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  54.74 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  46.43 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  46.43 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  46.43 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  48.91 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  46.43 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  47.14 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  47.14 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 143 aa  153  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 147 aa  153  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  46.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  48.18 
 
 		 146 aa  153  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  45.71 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  47.3 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  45.71 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>