207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1805 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  71.43 
 
 		 140 aa  214  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  72.86 
 
 		 140 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  70 
 
 		 140 aa  210  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  66.43 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  56.43 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  53.24 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  51.09 
 
 		 136 aa  143  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  46.32 
 
 		 148 aa  137  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  48.91 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  47.45 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  45.65 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  46.72 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  47.06 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  45.14 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  49.24 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  47.45 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  48.91 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  46.72 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  38.41 
 
 		 179 aa  104  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  42.14 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  41.13 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  39.58 
 
 		 200 aa  91.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.11 
 
 		 199 aa  90.1  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  41.26 
 
 		 199 aa  90.1  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  41.28 
 
 		 186 aa  87  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  37.24 
 
 		 202 aa  85.5  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  33.57 
 
 		 185 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  34.06 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  35.51 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  41.82 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  35.42 
 
 		 201 aa  77  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  35.78 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  30.61 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  29.6 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  27.91 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  27.78 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  26.36 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  27.69 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  29.6 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  30.77 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  32.17 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  31.01 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  25.38 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  27.91 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  26.36 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  30.23 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  26.36 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  27.83 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  27.2 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>