More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2389 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  68.57 
 
 		 140 aa  200  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  53.24 
 
 		 140 aa  160  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  53.96 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  51.08 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  51.8 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  53.96 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  48.2 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  49.64 
 
 		 149 aa  141  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  46.32 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  45.99 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  45.59 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  45.39 
 
 		 138 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  46.97 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  45.45 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  45.45 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  45.45 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  39.55 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  42.55 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  42.96 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  44.68 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  39.86 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  42.66 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  40.97 
 
 		 200 aa  95.9  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  39.16 
 
 		 185 aa  94.7  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  40 
 
 		 202 aa  93.2  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  40.28 
 
 		 182 aa  92.8  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.43 
 
 		 199 aa  91.3  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  37.06 
 
 		 199 aa  87.4  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  35.62 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  35.42 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  31.11 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  31.11 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  33.93 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  31.01 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  31.01 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  35.71 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  30.95 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  30.83 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  31.67 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  31.01 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  33.05 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  32.54 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  29.06 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  32.5 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  36.67 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0015  ribosomal protein L13  30.65 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  32.31 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  32.56 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  31.11 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  31.06 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  30.53 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  28.93 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  30.77 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  28.68 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  30.23 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  27.91 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  27.91 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  31.5 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  30.3 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  30.83 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  33.08 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  34.4 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  31.01 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  32.62 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  32.62 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  30 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  32.56 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  31.01 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  28.93 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  28.35 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  29.06 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  29.06 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  32.54 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  29.69 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  28.21 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  32.28 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  29.06 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15678  Plastid ribosomal protein L13 large ribosomal subunit  29.23 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0368905  hitchhiker  0.00903198 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  26.67 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  28.26 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>