More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1971 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  78.74 
 
 		 185 aa  290  6e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  75 
 
 		 186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  74.43 
 
 		 186 aa  278  4e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  50.87 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  51.39 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  38.19 
 
 		 140 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  38.19 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  40.28 
 
 		 136 aa  94  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  41.61 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  40.28 
 
 		 139 aa  92.8  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  37.59 
 
 		 149 aa  92  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  37.24 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  38.03 
 
 		 147 aa  87.8  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  44.55 
 
 		 140 aa  87.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  37.24 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  36.55 
 
 		 148 aa  86.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  32.87 
 
 		 138 aa  84.3  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  35.17 
 
 		 151 aa  84.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  41.24 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  41.82 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  32.64 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  32.86 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  32.35 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  35.5 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  40.91 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  36.43 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  41.18 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  41.18 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  32.17 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  41.18 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.73 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  35.96 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  35.96 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  33.91 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0911  50S ribosomal protein L13  33.91 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  29.41 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  34.78 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  33.91 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  33.91 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  36.67 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  33.91 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  37.5 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  35.07 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  35.07 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  36.67 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  33.59 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  37.07 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  32.46 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  35 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  35 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  39.47 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  35.04 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  33.08 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  37.29 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  33.88 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  32.79 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  33.91 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  32.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  34.17 
 
 		 154 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  32.37 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  36.89 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  35.09 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  32.79 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  34.21 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  35 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  32.46 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  30.83 
 
 		 149 aa  51.6  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  33.61 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  31.09 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  35 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  35.09 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  33.61 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  33.59 
 
 		 147 aa  51.2  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  33.61 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0401  50S ribosomal protein L13  38.05 
 
 		 150 aa  51.2  0.000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  33.91 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  33.61 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  34.43 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  34.78 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>