239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2383 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  71.43 
 
 		 140 aa  214  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  68.57 
 
 		 140 aa  199  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  60.71 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  62.86 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  57.14 
 
 		 140 aa  160  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  51.08 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  53.28 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  44.12 
 
 		 148 aa  127  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  46.72 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  45.65 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  45.26 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  49.28 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  47.92 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  48.55 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  48.55 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  50 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  42.75 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  43.38 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  42.14 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  42.14 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  46.23 
 
 		 179 aa  96.3  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  34.75 
 
 		 154 aa  88.6  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  40.28 
 
 		 200 aa  89  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  37.41 
 
 		 185 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  42.2 
 
 		 186 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  40 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  34.78 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.23 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  32.86 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  38.05 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  35.17 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  34.93 
 
 		 201 aa  67  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  30.71 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  31.79 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  30.36 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  29.29 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  28.37 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  27.68 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  30.36 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  30.36 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  29.29 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  28.46 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  30.16 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  29.23 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  29.84 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  28.46 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  27.82 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15678  Plastid ribosomal protein L13 large ribosomal subunit  30.43 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0368905  hitchhiker  0.00903198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  27.35 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  32.14 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  29.69 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  36.84 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_002620  TC0401  50S ribosomal protein L13  31.53 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  30.36 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  32.74 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  29.31 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  31.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  27.14 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  29.29 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  31.9 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  29.2 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  29.58 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  28.57 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  28.42 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  30.36 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  25.89 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>