287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2897 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  72.86 
 
 		 140 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  68.57 
 
 		 140 aa  199  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  67.14 
 
 		 140 aa  198  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  59.29 
 
 		 140 aa  168  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  57.86 
 
 		 140 aa  164  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  53.96 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  54.35 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  50.36 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  49.28 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  48.55 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  46.21 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  45.14 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  50.36 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  48.48 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  49.24 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  48.91 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  48.18 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  49.55 
 
 		 179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  41.01 
 
 		 154 aa  99.4  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  42.55 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  42.86 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  44.55 
 
 		 185 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  43.93 
 
 		 186 aa  90.1  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  50.96 
 
 		 199 aa  89.4  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  38.96 
 
 		 200 aa  90.1  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  39.31 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  44.55 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  36.43 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.44 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  39.09 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  40.91 
 
 		 201 aa  73.9  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  30.4 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  29.51 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  29.17 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  28.32 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  28.68 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  27.27 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  27.91 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  28.33 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  28.33 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  26.36 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  30.36 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  27.2 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  28.33 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  26.32 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  28.69 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  25.81 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  27.69 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  29.85 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  28.33 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  27.5 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  28.33 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  26.61 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  30.36 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  27.82 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  28.38 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  28.33 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  25.83 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  27.5 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  27.5 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  27.5 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  27.5 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 144 aa  47.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  26.67 
 
 		 143 aa  47.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  30.4 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  32.56 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  27.5 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  30.83 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  27.14 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  28.7 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  28.33 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  25 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  26.52 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  28.46 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  29.5 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  25.4 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  29.5 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  29.5 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  25.76 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  25.76 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  28.68 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  26.67 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  27.68 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15678  Plastid ribosomal protein L13 large ribosomal subunit  29.55 
 
 		 218 aa  47  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0368905  hitchhiker  0.00903198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2727  ribosomal protein L13  26.4 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000734549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  26.67 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  27.42 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  25.4 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  29.92 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>